网络药理学探究参苓白术散防治腹泻的机制
广西中医药大学, 赛恩斯新医药学院, 广西南宁 530222
| 摘 要： | 基于网络药理学和分子对接研究参苓白术散防治腹泻的分子机制。通过TCMSP数据库、PubChem数据库、Swiss TargetPrediction检索并收集参苓白术散的活性成分及活性成分对应的相关靶点。借助GeneCards数据库、OMIM数据库、DisGeNET数据库，以“Diarrhea”为关键词搜索疾病相关靶点，并将得到的药物成分作用靶点与疾病靶点作交集得到参苓白术散作用于腹泻的预测靶点。采用Cytoscape3.9.1软件构建“药物—活性成分—靶点网络”图。利用String数据库获取蛋白互作信息，进一步通过CytoNCA插件对靶点网络进行模块分析，筛选核心作用靶点。运用微生信平台将核心靶点进行KEGG通路富集分析，并根据富集结果。筛选得到参苓白术散1022个对应靶点，腹泻相关靶点920个，相交127个靶点。KEGG富集分析表明核心靶点作用于PI3K-Akt signaling pathwa、Human T-cell leukemia virus 1 ntection、Kaposi sarcoma-associated herpesvirus intection、Measles、Proteoglyeans in cancer等10条通路。通过网络药理学的研究，参苓白术散调控腹泻涉及127个靶点以及10条通路，表明参苓白术散可通过多成分、多靶点、多途径发挥防治腹泻的作用。 |
| 关 键 词： | 参苓白术散; 腹泻; 网络药理学; 分子对接; PI3K |
| DOI： | 10.57237/j.mrf.2023.03.001 |
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收稿日期: 2023-04-16
接受日期: 2023-05-25
在线出版日期: 2023-06-15
Network Pharmacology to Investigate the Mechanism of Ginseng and Atractylodis Macrocephalae to Prevent Diarrhea
Faculty of Chinese Medicine Science, Guangxi University of Chinese Medicine, Nanning 530222, China
| Abstract: | To investigate the molecular mechanism of Ginseng and Atractylodes macrocephala in the prevention and treatment of diarrhea based on network pharmacology and molecular docking. The active ingredients and the related targets of Ginseng and Atractylodes were searched and collected through TCMSP database, PubChem database and Swiss TargetPrediction. With the help of GeneCards database, OMIM database and DisGeNET database, we searched for disease related targets with "Diarrhea" as the keyword, and the obtained targets of drug ingredients were intersected with the disease targets to obtain the results. The predicted targets of Ginseng and Atractylodes for diarrhea were obtained by intersection. Cytoscape 3.9.1 software was used to construct the "drug-active ingredient-target network" diagram. Protein interaction information was obtained by using String database, and the target network was further analyzed by CytoNCA plug-in to screen the core targets. The core targets were enriched by KEGG pathway analysis using the microbiology platform, and the results were based on the enrichment results. The KEGG enrichment analysis showed that the core targets acted on PI3K-Akt signaling pathwa, Human T-cell leukemia virus 1 ntection, Kaposi sarcoma- associated herpesvirus intection, Measles, Proteoglyeans in cancer, and 10 other pathways. Through the network pharmacology study, Ginseng and Atractylodesan regulated diarrhea involving 127 targets and 10 pathways, indicating that Ginseng and Atractylodesan can exert its effects on diarrhea prevention and treatment through multiple components, targets and pathways. |
| Keywords: | Ginseng and Atractylodes; Diarrhea; Network Pharmacology; Molecular Docking; PI3K |
基金
| 1. | 国家自然科学基金项目 (编号: 82204755, 81960751) |
| 2. | 广西自然科学基金青年项目 (编号: 2023GXNSFBA026274) |
| 3. | 广西中青年教师科研基础能力提升项目 (2022KY1667) |
| 4. | 广西中医药大学赛恩斯新医药学院科研项目 (编号: 2022MS008, 2022QJ001) |
| 5. | 广西中医药大学赛恩斯新医药学院国家级大学生创新创业项目 (202213643018) |
| 6. | 广西中医药大学青年基金项目 (编号: 2022QN008) |
参考文献
| [1] | 陈青垚, 王梁凤, 李慧婷, 王堯, 柳小莉, 徐杰, 杨明, 王芳, 张小飞. 含丁香方剂的数据挖掘及其治疗腹泻的作用机制分析 [J]. 中国实验方剂学杂志, 2021, 27 (5): 158-170. |
| [2] | 陈影, 李硕, 苏萍, 张海静, 张广平, 叶祖光. 中药抗腹泻的药效作用及机制研究进展 [J]. 中国实验方剂学杂志, 2019, 25 (21): 203-211. |
| [3] | 孙墨晗, 靳玉秋, 赵哲, 田萌媛, 胡蓉, 陈光顺. 基于网络药理学和细胞实验探讨参苓白术散对肝纤维化中TGF-β通路的作用机制 [J]. 中医药信息, 2023, 40 (1): 19-29. |
| [4] | 刘羽茜, 王艳杰, 张林, 赵丹玉, 王建光, 贾连群, 张云亭. 基于网络药理学和分子对接法探讨参苓白术散治疗肺癌分子机制 [J]. 辽宁中医药大学学报, 2022, 24 (3): 53-59. |
| [5] | 张慈浩, 刘艳梅, 毛婷婷, 孙倩倩, 李陈垚, 陈孝为, 董筠.基于网络药理学及分子对接探讨肠复安治疗腹泻型肠易激综合征的机制研究 [J]. 中医临床研究, 2022, 14 (32): 1-7. |
| [6] | 王涛, 邹文俊, 张璐, 李洋, 郝俊杰, 赵艳玲. 基于网络药理学预测四逆汤抗心力衰竭的作用机制 [J]. 中国医院用药评价与分析, 2017, 17 (10): 1304-1306. |
| [7] | 李安安, 姜涛, 詹敏, 蔡宇宁, 宋敏, 李聪聪, 林文政, 张家媛, 刘文刚. 参苓白术散治疗膝骨关节炎作用机制的网络药理学和分子对接技术分析 [J]. 中国组织工程研究, 2022, 26 (2): 197-204. |
| [8] | 李涛, 谢慧春, 于伟, 阮瑞曼, 冯晓娟, 何建平. 羌活提取物的抗腹泻作用 [J]. 陕西师范大学学报 (自然科学版), 2014, 42 (5): 60-64. |
| [9] | 史志恒, 曾嘉琳, 黄欣如, 彭雨涵, 苏薇薇, 王永刚. 槲皮素及其衍生物抗病毒活性研究进展 [J]. 中国现代应用药学, 2022, 39 (18): 2412-2420. |
| [10] | 张宝徽, 鲁云, 胡则林, 郑国华. 反相高效液相色谱法测定人字草中槲皮素和木犀草素的含量 [J]. 湖北中医药大学学报, 2013, 15 (1): 28-30. |
| [11] | 梅华迪, 李袁飞, 马现永, 余苗. 槲皮素对动物肠道黏膜屏障功能的影响及其调控机制 [J]. 动物营养学报, 2022, 34 (9): 5475-5488. |
| [12] | 田文国, 陈金鹏, 王春芳, 刘毅, 盖晓红, 刘全国, 田成旺, 陈常青. 基于网络药理学和分子对接探究肠炎宁颗粒治疗功能性腹泻和腹泻型肠易激综合征的作用机制 [J]. 中草药, 2022, 53 (22) 7135-7147. |
| [13] | 夏利显, 周娇俐, 梅丽俊, 何凌. 痛泻要方通过PI3K-AKT通路诱导细胞自噬治疗腹泻型肠易激综合征的机制 [J]. 世界中西医结合杂志, 2021, 16 (3): 468-471+504. |
| [14] | 李哲, 李娜, 崔晓燕, 赵蓝青青, 于永洲, 赵春颖, 熊辉. 基于网络药理学和实验验证探讨陈皮藿香汤治疗腹泻的作用机制 [J]. 中国实验方剂学杂志, 2022, 28 (23): 79-86. |
| [15] | 王淑玉, 张运玲, 牛文艳.益生菌联合蒙脱石散治疗新生儿腹泻的临床效果 [J]. 中国城乡企业卫生, 2023, 38 (2): 137-139. |
| [16] | 杨瑞泉, 李晓龙, 王新琴. 药物治疗合并推拿手法治疗小儿腹泻疗效观察 [J]. 农垦医学, 2014, 36 (3): 245-246. |
| [17] | Qu Q, Yang F, Zhao C, Liu X, Yang P, Li Z, Han L, Shi X. Effects of fermented ginseng on the gut microbiota and immunity of rats with antibiotic-associated diarrhea [J]. J Ethnopharmacol. 2021, 267: 113594. |
| [18] | 唐远江, 冯将, 余波, 张涛, 卢昱希, 姜玲玲. 复方中药制剂对小鼠腹泻的治疗作用研究 [J]. 湖南农业科学, 2019 (3): 17-20. |
